Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ribc2Q9D4Q1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ribc2Q9D4Q1 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ribc2Q9D4Q1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Ribc2Q9D4Q1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ribc2Q9D4Q1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms