Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rufy3Q9D394 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms