Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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