Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lmbr1lQ9D1E5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms