Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Susd3Q9D176 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms