Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hddc3Q9D114 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms