Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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