Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
ChtopQ9CY57 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms