Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms