Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rpl11Q9CXW4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms