Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nip7Q9CXK8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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