Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Sgo1Q9CXH7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Sgo1Q9CXH7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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