Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pfdn1Q9CWM4 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pfdn1Q9CWM4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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