Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Fcf1Q9CTH6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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