Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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