Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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