Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ccer1Q9CQL2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ccer1Q9CQL2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ccer1Q9CQL2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ccer1Q9CQL2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ccer1Q9CQL2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ccer1Q9CQL2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccer1Q9CQL2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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Ccer1Q9CQL2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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