Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms