Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q9CQC3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms