Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prpf8Q99PV0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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