Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hdac9Q99N13 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms