Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp1b4Q99ME6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms