Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms