Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hps4Q99KG7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hps4Q99KG7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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