Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ophn1Q99J31 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ophn1Q99J31 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms