Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
CsprsQ99388 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms