Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cldn16Q925N4 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cldn16Q925N4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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