Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Rnf144aQ925F3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rnf144aQ925F3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
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