Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hps3Q91VB4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hps3Q91VB4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms