Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SelenomQ8VHC3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SelenomQ8VHC3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms