Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg8Q8VE18 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Smg8Q8VE18 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Smg8Q8VE18 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smg8Q8VE18 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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