Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc39cQ8VE09 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms