Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rprd1aQ8VDS4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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