Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Sft2d2Q8VD57 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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