Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ubxn4Q8VCH8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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