Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApobrQ8VBT6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms