Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Hoxc12Q8K5B8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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