Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hecw1Q8K4P8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hecw1Q8K4P8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms