Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Abcf3Q8K268 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Abcf3Q8K268 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Abcf3Q8K268 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Abcf3Q8K268 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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