Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nek9Q8K1R7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek9Q8K1R7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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