Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Cldn34c1Q8K193 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn34c1Q8K193 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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