Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Snx8Q8CFD4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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