Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Gm9955Q8CEJ8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Gm9955Q8CEJ8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Gm9955Q8CEJ8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Gm9955Q8CEJ8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
Gm9955Q8CEJ8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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Gm9955Q8CEJ8 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Gm9955Q8CEJ8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Gm9955Q8CEJ8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Gm9955Q8CEJ8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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Gm9955Q8CEJ8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Gm9955Q8CEJ8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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