Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc28aQ8CEI3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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