Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp27Q8CEG8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Usp27Q8CEG8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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