Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Nhlrc3Q8CCH2 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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