Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tsr2Q8C8T8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms