Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Q8C708 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Q8C708 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Q8C708 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Q8C708 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms