Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nlrp4bQ8C6J9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nlrp4bQ8C6J9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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