Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc113Q8C5T8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms